Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CATSPER4Q7RTX7 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CATSPER4Q7RTX7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CATSPER4Q7RTX7 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CATSPER4Q7RTX7 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CATSPER4Q7RTX7 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CATSPER4Q7RTX7 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CATSPER4Q7RTX7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CATSPER4Q7RTX7 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CATSPER4Q7RTX7 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CATSPER4Q7RTX7 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CATSPER4Q7RTX7 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CATSPER4Q7RTX7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CATSPER4Q7RTX7 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CATSPER4Q7RTX7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CATSPER4Q7RTX7 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CATSPER4Q7RTX7 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CATSPER4Q7RTX7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CATSPER4Q7RTX7 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CATSPER4Q7RTX7 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CATSPER4Q7RTX7 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CATSPER4Q7RTX7 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CATSPER4Q7RTX7 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CATSPER4Q7RTX7 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CATSPER4Q7RTX7 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CATSPER4Q7RTX7 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CATSPER4Q7RTX7 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CATSPER4Q7RTX7 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CATSPER4Q7RTX7 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CATSPER4Q7RTX7 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CATSPER4Q7RTX7 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CATSPER4Q7RTX7 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CATSPER4Q7RTX7 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CATSPER4Q7RTX7 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CATSPER4Q7RTX7 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CATSPER4Q7RTX7 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CATSPER4Q7RTX7 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CATSPER4Q7RTX7 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CATSPER4Q7RTX7 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CATSPER4Q7RTX7 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CATSPER4Q7RTX7 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CATSPER4Q7RTX7 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CATSPER4Q7RTX7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CATSPER4Q7RTX7 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CATSPER4Q7RTX7 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CATSPER4Q7RTX7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms