Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms