Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGC8

CHST3, Carbohydrate sulfotransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST3Q7LGC8 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CHST3Q7LGC8 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms