Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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USP43Q70EL4 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
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USP43Q70EL4 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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USP43Q70EL4 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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USP43Q70EL4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
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USP43Q70EL4 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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USP43Q70EL4 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
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USP43Q70EL4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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USP43Q70EL4 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
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USP43Q70EL4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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