Protein–RNA interactions for Protein: Q702N8

XIRP1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP1Q702N8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
XIRP1Q702N8 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
XIRP1Q702N8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
XIRP1Q702N8 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
XIRP1Q702N8 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
XIRP1Q702N8 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
XIRP1Q702N8 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
XIRP1Q702N8 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
XIRP1Q702N8 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
XIRP1Q702N8 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
XIRP1Q702N8 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
XIRP1Q702N8 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
XIRP1Q702N8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
XIRP1Q702N8 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
XIRP1Q702N8 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
XIRP1Q702N8 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
XIRP1Q702N8 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
XIRP1Q702N8 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
XIRP1Q702N8 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
XIRP1Q702N8 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
XIRP1Q702N8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
XIRP1Q702N8 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
XIRP1Q702N8 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
XIRP1Q702N8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
XIRP1Q702N8 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
XIRP1Q702N8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
XIRP1Q702N8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
XIRP1Q702N8 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
XIRP1Q702N8 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
XIRP1Q702N8 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
XIRP1Q702N8 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
XIRP1Q702N8 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
XIRP1Q702N8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
XIRP1Q702N8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
XIRP1Q702N8 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
XIRP1Q702N8 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
XIRP1Q702N8 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
XIRP1Q702N8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
XIRP1Q702N8 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
XIRP1Q702N8 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
XIRP1Q702N8 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
XIRP1Q702N8 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
XIRP1Q702N8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
XIRP1Q702N8 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
XIRP1Q702N8 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
XIRP1Q702N8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
XIRP1Q702N8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
XIRP1Q702N8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
XIRP1Q702N8 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
XIRP1Q702N8 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
XIRP1Q702N8 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
XIRP1Q702N8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
XIRP1Q702N8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
XIRP1Q702N8 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
XIRP1Q702N8 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
XIRP1Q702N8 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
XIRP1Q702N8 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
XIRP1Q702N8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
XIRP1Q702N8 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
XIRP1Q702N8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
XIRP1Q702N8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
XIRP1Q702N8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
XIRP1Q702N8 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
XIRP1Q702N8 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
XIRP1Q702N8 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
XIRP1Q702N8 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
XIRP1Q702N8 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
XIRP1Q702N8 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
XIRP1Q702N8 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
XIRP1Q702N8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
XIRP1Q702N8 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
XIRP1Q702N8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
XIRP1Q702N8 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
XIRP1Q702N8 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
XIRP1Q702N8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
XIRP1Q702N8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
XIRP1Q702N8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
XIRP1Q702N8 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
XIRP1Q702N8 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
XIRP1Q702N8 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
XIRP1Q702N8 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
XIRP1Q702N8 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
XIRP1Q702N8 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
XIRP1Q702N8 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
XIRP1Q702N8 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
XIRP1Q702N8 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
XIRP1Q702N8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
XIRP1Q702N8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
XIRP1Q702N8 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
XIRP1Q702N8 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
XIRP1Q702N8 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
XIRP1Q702N8 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
XIRP1Q702N8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
XIRP1Q702N8 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
XIRP1Q702N8 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
XIRP1Q702N8 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
XIRP1Q702N8 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
XIRP1Q702N8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
XIRP1Q702N8 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
XIRP1Q702N8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms