Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms