Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMZ3

SYNE3, Nesprin-3, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE3Q6ZMZ3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNE3Q6ZMZ3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms