Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms