Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRAIDQ6UW56 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms