Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZBED9Q6R2W3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
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