Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUI1

CCDC144NL, Putative coiled-coil domain-containing protein 144 N-terminal-like, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144NLQ6NUI1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms