Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF9

RHBDD2, Rhomboid domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD2Q6NTF9 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHBDD2Q6NTF9 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms