Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
CARMIL1Q5VZK9 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CARMIL1Q5VZK9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CARMIL1Q5VZK9 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CARMIL1Q5VZK9 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CARMIL1Q5VZK9 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CARMIL1Q5VZK9 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CARMIL1Q5VZK9 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
CARMIL1Q5VZK9 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CARMIL1Q5VZK9 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CARMIL1Q5VZK9 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CARMIL1Q5VZK9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
CARMIL1Q5VZK9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CARMIL1Q5VZK9 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CARMIL1Q5VZK9 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
CARMIL1Q5VZK9 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CARMIL1Q5VZK9 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CARMIL1Q5VZK9 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
CARMIL1Q5VZK9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
CARMIL1Q5VZK9 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
CARMIL1Q5VZK9 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
CARMIL1Q5VZK9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CARMIL1Q5VZK9 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC32■■■□□ 2.71
CARMIL1Q5VZK9 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CARMIL1Q5VZK9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
CARMIL1Q5VZK9 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
CARMIL1Q5VZK9 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CARMIL1Q5VZK9 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CARMIL1Q5VZK9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CARMIL1Q5VZK9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CARMIL1Q5VZK9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CARMIL1Q5VZK9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CARMIL1Q5VZK9 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CARMIL1Q5VZK9 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CARMIL1Q5VZK9 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CARMIL1Q5VZK9 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CARMIL1Q5VZK9 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CARMIL1Q5VZK9 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CARMIL1Q5VZK9 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CARMIL1Q5VZK9 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CARMIL1Q5VZK9 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CARMIL1Q5VZK9 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CARMIL1Q5VZK9 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CARMIL1Q5VZK9 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms