Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms