Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF20Q5VTR2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF20Q5VTR2 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF20Q5VTR2 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF20Q5VTR2 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF20Q5VTR2 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF20Q5VTR2 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF20Q5VTR2 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF20Q5VTR2 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF20Q5VTR2 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF20Q5VTR2 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF20Q5VTR2 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF20Q5VTR2 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF20Q5VTR2 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF20Q5VTR2 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF20Q5VTR2 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF20Q5VTR2 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF20Q5VTR2 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF20Q5VTR2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF20Q5VTR2 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF20Q5VTR2 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF20Q5VTR2 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF20Q5VTR2 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF20Q5VTR2 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF20Q5VTR2 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF20Q5VTR2 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF20Q5VTR2 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF20Q5VTR2 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF20Q5VTR2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF20Q5VTR2 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF20Q5VTR2 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF20Q5VTR2 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF20Q5VTR2 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF20Q5VTR2 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF20Q5VTR2 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF20Q5VTR2 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF20Q5VTR2 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF20Q5VTR2 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF20Q5VTR2 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF20Q5VTR2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF20Q5VTR2 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF20Q5VTR2 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF20Q5VTR2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF20Q5VTR2 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF20Q5VTR2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF20Q5VTR2 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF20Q5VTR2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF20Q5VTR2 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF20Q5VTR2 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF20Q5VTR2 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF20Q5VTR2 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF20Q5VTR2 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF20Q5VTR2 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF20Q5VTR2 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF20Q5VTR2 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF20Q5VTR2 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF20Q5VTR2 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF20Q5VTR2 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF20Q5VTR2 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF20Q5VTR2 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF20Q5VTR2 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF20Q5VTR2 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF20Q5VTR2 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF20Q5VTR2 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF20Q5VTR2 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF20Q5VTR2 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF20Q5VTR2 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF20Q5VTR2 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF20Q5VTR2 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF20Q5VTR2 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF20Q5VTR2 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF20Q5VTR2 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF20Q5VTR2 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF20Q5VTR2 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF20Q5VTR2 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF20Q5VTR2 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF20Q5VTR2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF20Q5VTR2 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF20Q5VTR2 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF20Q5VTR2 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF20Q5VTR2 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RNF20Q5VTR2 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF20Q5VTR2 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms