Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT52

RPRD2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD2Q5VT52 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RPRD2Q5VT52 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RPRD2Q5VT52 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
RPRD2Q5VT52 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RPRD2Q5VT52 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
RPRD2Q5VT52 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
RPRD2Q5VT52 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms