Protein–RNA interactions for Protein: Q5T1R4

HIVEP3, Transcription factor HIVEP3, humanhuman

Predictions only

Length 2,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP3Q5T1R4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms