Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0N1

CFAP70, Cilia- and flagella-associated protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 1,121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP70Q5T0N1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CFAP70Q5T0N1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CFAP70Q5T0N1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CFAP70Q5T0N1 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CFAP70Q5T0N1 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CFAP70Q5T0N1 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CFAP70Q5T0N1 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CFAP70Q5T0N1 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CFAP70Q5T0N1 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CFAP70Q5T0N1 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CFAP70Q5T0N1 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CFAP70Q5T0N1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CFAP70Q5T0N1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CFAP70Q5T0N1 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CFAP70Q5T0N1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CFAP70Q5T0N1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CFAP70Q5T0N1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CFAP70Q5T0N1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CFAP70Q5T0N1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CFAP70Q5T0N1 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CFAP70Q5T0N1 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CFAP70Q5T0N1 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CFAP70Q5T0N1 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CFAP70Q5T0N1 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CFAP70Q5T0N1 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CFAP70Q5T0N1 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CFAP70Q5T0N1 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CFAP70Q5T0N1 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CFAP70Q5T0N1 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CFAP70Q5T0N1 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CFAP70Q5T0N1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CFAP70Q5T0N1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CFAP70Q5T0N1 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CFAP70Q5T0N1 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CFAP70Q5T0N1 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CFAP70Q5T0N1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CFAP70Q5T0N1 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CFAP70Q5T0N1 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CFAP70Q5T0N1 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CFAP70Q5T0N1 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CFAP70Q5T0N1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CFAP70Q5T0N1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CFAP70Q5T0N1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CFAP70Q5T0N1 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CFAP70Q5T0N1 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CFAP70Q5T0N1 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CFAP70Q5T0N1 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CFAP70Q5T0N1 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CFAP70Q5T0N1 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CFAP70Q5T0N1 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CFAP70Q5T0N1 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CFAP70Q5T0N1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CFAP70Q5T0N1 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CFAP70Q5T0N1 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CFAP70Q5T0N1 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CFAP70Q5T0N1 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CFAP70Q5T0N1 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CFAP70Q5T0N1 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CFAP70Q5T0N1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CFAP70Q5T0N1 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CFAP70Q5T0N1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CFAP70Q5T0N1 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CFAP70Q5T0N1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CFAP70Q5T0N1 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CFAP70Q5T0N1 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CFAP70Q5T0N1 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CFAP70Q5T0N1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CFAP70Q5T0N1 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CFAP70Q5T0N1 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CFAP70Q5T0N1 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CFAP70Q5T0N1 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CFAP70Q5T0N1 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CFAP70Q5T0N1 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CFAP70Q5T0N1 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CFAP70Q5T0N1 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CFAP70Q5T0N1 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CFAP70Q5T0N1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CFAP70Q5T0N1 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CFAP70Q5T0N1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CFAP70Q5T0N1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CFAP70Q5T0N1 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CFAP70Q5T0N1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CFAP70Q5T0N1 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CFAP70Q5T0N1 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CFAP70Q5T0N1 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CFAP70Q5T0N1 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CFAP70Q5T0N1 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CFAP70Q5T0N1 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CFAP70Q5T0N1 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CFAP70Q5T0N1 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CFAP70Q5T0N1 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CFAP70Q5T0N1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CFAP70Q5T0N1 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CFAP70Q5T0N1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CFAP70Q5T0N1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CFAP70Q5T0N1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CFAP70Q5T0N1 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CFAP70Q5T0N1 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CFAP70Q5T0N1 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CFAP70Q5T0N1 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms