Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms