Protein–RNA interactions for Protein: Q53SF7

COBLL1, Cordon-bleu protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLL1Q53SF7 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COBLL1Q53SF7 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COBLL1Q53SF7 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COBLL1Q53SF7 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COBLL1Q53SF7 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COBLL1Q53SF7 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COBLL1Q53SF7 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COBLL1Q53SF7 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COBLL1Q53SF7 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COBLL1Q53SF7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COBLL1Q53SF7 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COBLL1Q53SF7 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
COBLL1Q53SF7 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COBLL1Q53SF7 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COBLL1Q53SF7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COBLL1Q53SF7 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COBLL1Q53SF7 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COBLL1Q53SF7 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
COBLL1Q53SF7 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COBLL1Q53SF7 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COBLL1Q53SF7 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COBLL1Q53SF7 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COBLL1Q53SF7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COBLL1Q53SF7 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COBLL1Q53SF7 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COBLL1Q53SF7 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COBLL1Q53SF7 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COBLL1Q53SF7 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COBLL1Q53SF7 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COBLL1Q53SF7 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COBLL1Q53SF7 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COBLL1Q53SF7 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COBLL1Q53SF7 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COBLL1Q53SF7 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COBLL1Q53SF7 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COBLL1Q53SF7 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COBLL1Q53SF7 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COBLL1Q53SF7 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COBLL1Q53SF7 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
COBLL1Q53SF7 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COBLL1Q53SF7 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COBLL1Q53SF7 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COBLL1Q53SF7 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COBLL1Q53SF7 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COBLL1Q53SF7 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COBLL1Q53SF7 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COBLL1Q53SF7 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COBLL1Q53SF7 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COBLL1Q53SF7 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COBLL1Q53SF7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COBLL1Q53SF7 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COBLL1Q53SF7 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COBLL1Q53SF7 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COBLL1Q53SF7 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COBLL1Q53SF7 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COBLL1Q53SF7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COBLL1Q53SF7 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
COBLL1Q53SF7 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
COBLL1Q53SF7 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COBLL1Q53SF7 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COBLL1Q53SF7 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
COBLL1Q53SF7 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
COBLL1Q53SF7 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COBLL1Q53SF7 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COBLL1Q53SF7 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COBLL1Q53SF7 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COBLL1Q53SF7 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COBLL1Q53SF7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COBLL1Q53SF7 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COBLL1Q53SF7 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COBLL1Q53SF7 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COBLL1Q53SF7 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COBLL1Q53SF7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COBLL1Q53SF7 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COBLL1Q53SF7 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COBLL1Q53SF7 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COBLL1Q53SF7 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COBLL1Q53SF7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COBLL1Q53SF7 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COBLL1Q53SF7 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COBLL1Q53SF7 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COBLL1Q53SF7 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COBLL1Q53SF7 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COBLL1Q53SF7 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COBLL1Q53SF7 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
COBLL1Q53SF7 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
COBLL1Q53SF7 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COBLL1Q53SF7 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
COBLL1Q53SF7 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
COBLL1Q53SF7 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
COBLL1Q53SF7 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COBLL1Q53SF7 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COBLL1Q53SF7 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COBLL1Q53SF7 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COBLL1Q53SF7 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COBLL1Q53SF7 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COBLL1Q53SF7 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COBLL1Q53SF7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COBLL1Q53SF7 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COBLL1Q53SF7 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms