Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LETM2Q2VYF4 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LETM2Q2VYF4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LETM2Q2VYF4 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LETM2Q2VYF4 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LETM2Q2VYF4 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LETM2Q2VYF4 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LETM2Q2VYF4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LETM2Q2VYF4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LETM2Q2VYF4 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LETM2Q2VYF4 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LETM2Q2VYF4 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LETM2Q2VYF4 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LETM2Q2VYF4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LETM2Q2VYF4 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LETM2Q2VYF4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LETM2Q2VYF4 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LETM2Q2VYF4 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LETM2Q2VYF4 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LETM2Q2VYF4 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LETM2Q2VYF4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LETM2Q2VYF4 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LETM2Q2VYF4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LETM2Q2VYF4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LETM2Q2VYF4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LETM2Q2VYF4 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LETM2Q2VYF4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LETM2Q2VYF4 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LETM2Q2VYF4 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LETM2Q2VYF4 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LETM2Q2VYF4 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LETM2Q2VYF4 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LETM2Q2VYF4 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LETM2Q2VYF4 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LETM2Q2VYF4 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LETM2Q2VYF4 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LETM2Q2VYF4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LETM2Q2VYF4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LETM2Q2VYF4 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LETM2Q2VYF4 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LETM2Q2VYF4 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LETM2Q2VYF4 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LETM2Q2VYF4 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LETM2Q2VYF4 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LETM2Q2VYF4 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LETM2Q2VYF4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LETM2Q2VYF4 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LETM2Q2VYF4 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LETM2Q2VYF4 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LETM2Q2VYF4 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LETM2Q2VYF4 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LETM2Q2VYF4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LETM2Q2VYF4 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LETM2Q2VYF4 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LETM2Q2VYF4 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LETM2Q2VYF4 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LETM2Q2VYF4 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LETM2Q2VYF4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LETM2Q2VYF4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LETM2Q2VYF4 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LETM2Q2VYF4 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LETM2Q2VYF4 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LETM2Q2VYF4 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LETM2Q2VYF4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LETM2Q2VYF4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LETM2Q2VYF4 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LETM2Q2VYF4 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LETM2Q2VYF4 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LETM2Q2VYF4 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LETM2Q2VYF4 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LETM2Q2VYF4 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LETM2Q2VYF4 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LETM2Q2VYF4 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LETM2Q2VYF4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LETM2Q2VYF4 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LETM2Q2VYF4 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LETM2Q2VYF4 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LETM2Q2VYF4 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LETM2Q2VYF4 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LETM2Q2VYF4 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LETM2Q2VYF4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LETM2Q2VYF4 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LETM2Q2VYF4 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LETM2Q2VYF4 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LETM2Q2VYF4 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LETM2Q2VYF4 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LETM2Q2VYF4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LETM2Q2VYF4 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LETM2Q2VYF4 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LETM2Q2VYF4 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LETM2Q2VYF4 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LETM2Q2VYF4 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LETM2Q2VYF4 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LETM2Q2VYF4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LETM2Q2VYF4 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LETM2Q2VYF4 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LETM2Q2VYF4 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LETM2Q2VYF4 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LETM2Q2VYF4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LETM2Q2VYF4 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
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