Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

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Length 1,700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SPHKAPQ2M3C7 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SPHKAPQ2M3C7 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SPHKAPQ2M3C7 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SPHKAPQ2M3C7 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SPHKAPQ2M3C7 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SPHKAPQ2M3C7 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SPHKAPQ2M3C7 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SPHKAPQ2M3C7 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SPHKAPQ2M3C7 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SPHKAPQ2M3C7 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPHKAPQ2M3C7 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPHKAPQ2M3C7 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPHKAPQ2M3C7 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SPHKAPQ2M3C7 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPHKAPQ2M3C7 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPHKAPQ2M3C7 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SPHKAPQ2M3C7 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPHKAPQ2M3C7 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPHKAPQ2M3C7 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPHKAPQ2M3C7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPHKAPQ2M3C7 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPHKAPQ2M3C7 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPHKAPQ2M3C7 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPHKAPQ2M3C7 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPHKAPQ2M3C7 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPHKAPQ2M3C7 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPHKAPQ2M3C7 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPHKAPQ2M3C7 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPHKAPQ2M3C7 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPHKAPQ2M3C7 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPHKAPQ2M3C7 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPHKAPQ2M3C7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPHKAPQ2M3C7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPHKAPQ2M3C7 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SPHKAPQ2M3C7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SPHKAPQ2M3C7 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SPHKAPQ2M3C7 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SPHKAPQ2M3C7 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SPHKAPQ2M3C7 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SPHKAPQ2M3C7 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SPHKAPQ2M3C7 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SPHKAPQ2M3C7 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SPHKAPQ2M3C7 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SPHKAPQ2M3C7 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SPHKAPQ2M3C7 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SPHKAPQ2M3C7 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SPHKAPQ2M3C7 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SPHKAPQ2M3C7 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SPHKAPQ2M3C7 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SPHKAPQ2M3C7 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SPHKAPQ2M3C7 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SPHKAPQ2M3C7 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SPHKAPQ2M3C7 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SPHKAPQ2M3C7 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SPHKAPQ2M3C7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SPHKAPQ2M3C7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SPHKAPQ2M3C7 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SPHKAPQ2M3C7 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SPHKAPQ2M3C7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SPHKAPQ2M3C7 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SPHKAPQ2M3C7 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SPHKAPQ2M3C7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SPHKAPQ2M3C7 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SPHKAPQ2M3C7 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SPHKAPQ2M3C7 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SPHKAPQ2M3C7 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SPHKAPQ2M3C7 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SPHKAPQ2M3C7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SPHKAPQ2M3C7 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SPHKAPQ2M3C7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SPHKAPQ2M3C7 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SPHKAPQ2M3C7 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SPHKAPQ2M3C7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SPHKAPQ2M3C7 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SPHKAPQ2M3C7 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SPHKAPQ2M3C7 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SPHKAPQ2M3C7 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SPHKAPQ2M3C7 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SPHKAPQ2M3C7 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SPHKAPQ2M3C7 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SPHKAPQ2M3C7 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SPHKAPQ2M3C7 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SPHKAPQ2M3C7 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SPHKAPQ2M3C7 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SPHKAPQ2M3C7 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SPHKAPQ2M3C7 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SPHKAPQ2M3C7 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SPHKAPQ2M3C7 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SPHKAPQ2M3C7 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SPHKAPQ2M3C7 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SPHKAPQ2M3C7 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SPHKAPQ2M3C7 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SPHKAPQ2M3C7 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SPHKAPQ2M3C7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SPHKAPQ2M3C7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SPHKAPQ2M3C7 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SPHKAPQ2M3C7 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SPHKAPQ2M3C7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SPHKAPQ2M3C7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
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