Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC96Q2M329 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms