Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2I5

KRT24, Keratin, type I cytoskeletal 24, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT24Q2M2I5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT24Q2M2I5 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT24Q2M2I5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT24Q2M2I5 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT24Q2M2I5 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT24Q2M2I5 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT24Q2M2I5 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT24Q2M2I5 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT24Q2M2I5 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT24Q2M2I5 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT24Q2M2I5 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT24Q2M2I5 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT24Q2M2I5 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT24Q2M2I5 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT24Q2M2I5 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT24Q2M2I5 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT24Q2M2I5 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT24Q2M2I5 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT24Q2M2I5 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT24Q2M2I5 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT24Q2M2I5 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT24Q2M2I5 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT24Q2M2I5 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms