Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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CCDC142Q17RM4 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC142Q17RM4 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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