Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IMPG1Q17R60 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IMPG1Q17R60 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IMPG1Q17R60 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IMPG1Q17R60 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
IMPG1Q17R60 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IMPG1Q17R60 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IMPG1Q17R60 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IMPG1Q17R60 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IMPG1Q17R60 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IMPG1Q17R60 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
IMPG1Q17R60 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IMPG1Q17R60 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IMPG1Q17R60 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IMPG1Q17R60 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IMPG1Q17R60 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
IMPG1Q17R60 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IMPG1Q17R60 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IMPG1Q17R60 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IMPG1Q17R60 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IMPG1Q17R60 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IMPG1Q17R60 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IMPG1Q17R60 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IMPG1Q17R60 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IMPG1Q17R60 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IMPG1Q17R60 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IMPG1Q17R60 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IMPG1Q17R60 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IMPG1Q17R60 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IMPG1Q17R60 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
IMPG1Q17R60 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IMPG1Q17R60 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IMPG1Q17R60 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IMPG1Q17R60 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
IMPG1Q17R60 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IMPG1Q17R60 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IMPG1Q17R60 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IMPG1Q17R60 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IMPG1Q17R60 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IMPG1Q17R60 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IMPG1Q17R60 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IMPG1Q17R60 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IMPG1Q17R60 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IMPG1Q17R60 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IMPG1Q17R60 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IMPG1Q17R60 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IMPG1Q17R60 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IMPG1Q17R60 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IMPG1Q17R60 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IMPG1Q17R60 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IMPG1Q17R60 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IMPG1Q17R60 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
IMPG1Q17R60 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
IMPG1Q17R60 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IMPG1Q17R60 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IMPG1Q17R60 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IMPG1Q17R60 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IMPG1Q17R60 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IMPG1Q17R60 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IMPG1Q17R60 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IMPG1Q17R60 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IMPG1Q17R60 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IMPG1Q17R60 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
IMPG1Q17R60 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IMPG1Q17R60 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IMPG1Q17R60 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
IMPG1Q17R60 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IMPG1Q17R60 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IMPG1Q17R60 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IMPG1Q17R60 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IMPG1Q17R60 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IMPG1Q17R60 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IMPG1Q17R60 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IMPG1Q17R60 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IMPG1Q17R60 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IMPG1Q17R60 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IMPG1Q17R60 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IMPG1Q17R60 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
IMPG1Q17R60 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
IMPG1Q17R60 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
IMPG1Q17R60 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
IMPG1Q17R60 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
IMPG1Q17R60 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
IMPG1Q17R60 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IMPG1Q17R60 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IMPG1Q17R60 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
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