Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UPP1Q16831 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms