Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

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Length 503 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NRF1Q16656 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NRF1Q16656 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NRF1Q16656 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NRF1Q16656 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NRF1Q16656 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NRF1Q16656 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NRF1Q16656 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NRF1Q16656 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NRF1Q16656 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NRF1Q16656 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NRF1Q16656 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NRF1Q16656 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NRF1Q16656 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NRF1Q16656 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NRF1Q16656 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NRF1Q16656 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NRF1Q16656 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NRF1Q16656 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NRF1Q16656 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NRF1Q16656 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NRF1Q16656 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NRF1Q16656 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NRF1Q16656 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NRF1Q16656 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NRF1Q16656 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NRF1Q16656 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NRF1Q16656 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NRF1Q16656 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NRF1Q16656 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NRF1Q16656 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NRF1Q16656 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NRF1Q16656 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NRF1Q16656 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NRF1Q16656 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NRF1Q16656 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NRF1Q16656 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NRF1Q16656 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NRF1Q16656 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NRF1Q16656 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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NRF1Q16656 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NRF1Q16656 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NRF1Q16656 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NRF1Q16656 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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NRF1Q16656 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NRF1Q16656 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NRF1Q16656 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NRF1Q16656 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NRF1Q16656 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NRF1Q16656 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NRF1Q16656 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NRF1Q16656 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NRF1Q16656 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NRF1Q16656 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NRF1Q16656 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NRF1Q16656 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NRF1Q16656 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NRF1Q16656 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NRF1Q16656 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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