Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC18A3Q16572 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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