Protein–RNA interactions for Protein: Q16526

CRY1, Cryptochrome-1, humanhuman

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY1Q16526 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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CRY1Q16526 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRY1Q16526 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRY1Q16526 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRY1Q16526 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRY1Q16526 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRY1Q16526 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRY1Q16526 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRY1Q16526 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CRY1Q16526 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CRY1Q16526 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CRY1Q16526 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRY1Q16526 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRY1Q16526 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CRY1Q16526 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRY1Q16526 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRY1Q16526 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRY1Q16526 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRY1Q16526 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CRY1Q16526 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRY1Q16526 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRY1Q16526 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRY1Q16526 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRY1Q16526 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRY1Q16526 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRY1Q16526 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CRY1Q16526 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRY1Q16526 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
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CRY1Q16526 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRY1Q16526 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRY1Q16526 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRY1Q16526 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRY1Q16526 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRY1Q16526 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRY1Q16526 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRY1Q16526 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRY1Q16526 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRY1Q16526 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRY1Q16526 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRY1Q16526 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CRY1Q16526 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CRY1Q16526 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRY1Q16526 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRY1Q16526 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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CRY1Q16526 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRY1Q16526 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRY1Q16526 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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CRY1Q16526 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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CRY1Q16526 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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CRY1Q16526 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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CRY1Q16526 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
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CRY1Q16526 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRY1Q16526 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRY1Q16526 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRY1Q16526 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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CRY1Q16526 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRY1Q16526 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRY1Q16526 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRY1Q16526 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CRY1Q16526 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRY1Q16526 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRY1Q16526 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRY1Q16526 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRY1Q16526 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRY1Q16526 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRY1Q16526 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRY1Q16526 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRY1Q16526 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRY1Q16526 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRY1Q16526 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRY1Q16526 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRY1Q16526 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
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