Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
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