Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms