Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
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