Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
NCOA1Q15788 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
NCOA1Q15788 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NCOA1Q15788 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NCOA1Q15788 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NCOA1Q15788 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NCOA1Q15788 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NCOA1Q15788 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NCOA1Q15788 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
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NCOA1Q15788 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NCOA1Q15788 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NCOA1Q15788 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
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NCOA1Q15788 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NCOA1Q15788 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NCOA1Q15788 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
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NCOA1Q15788 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NCOA1Q15788 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
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NCOA1Q15788 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
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NCOA1Q15788 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
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NCOA1Q15788 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NCOA1Q15788 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
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NCOA1Q15788 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
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NCOA1Q15788 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NCOA1Q15788 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
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NCOA1Q15788 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
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NCOA1Q15788 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
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NCOA1Q15788 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NCOA1Q15788 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
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NCOA1Q15788 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
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NCOA1Q15788 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NCOA1Q15788 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NCOA1Q15788 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NCOA1Q15788 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NCOA1Q15788 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NCOA1Q15788 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NCOA1Q15788 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NCOA1Q15788 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NCOA1Q15788 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NCOA1Q15788 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NCOA1Q15788 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NCOA1Q15788 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NCOA1Q15788 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NCOA1Q15788 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
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