Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNB3Q15768 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNB3Q15768 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNB3Q15768 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNB3Q15768 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNB3Q15768 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNB3Q15768 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNB3Q15768 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNB3Q15768 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNB3Q15768 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNB3Q15768 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNB3Q15768 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNB3Q15768 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNB3Q15768 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNB3Q15768 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNB3Q15768 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNB3Q15768 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNB3Q15768 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNB3Q15768 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNB3Q15768 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNB3Q15768 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNB3Q15768 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNB3Q15768 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNB3Q15768 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNB3Q15768 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNB3Q15768 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNB3Q15768 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNB3Q15768 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNB3Q15768 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNB3Q15768 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNB3Q15768 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNB3Q15768 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNB3Q15768 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNB3Q15768 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNB3Q15768 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNB3Q15768 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNB3Q15768 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNB3Q15768 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNB3Q15768 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNB3Q15768 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNB3Q15768 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNB3Q15768 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNB3Q15768 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNB3Q15768 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNB3Q15768 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNB3Q15768 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNB3Q15768 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNB3Q15768 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNB3Q15768 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNB3Q15768 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNB3Q15768 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNB3Q15768 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNB3Q15768 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNB3Q15768 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNB3Q15768 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNB3Q15768 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNB3Q15768 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNB3Q15768 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNB3Q15768 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNB3Q15768 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNB3Q15768 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNB3Q15768 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNB3Q15768 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNB3Q15768 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNB3Q15768 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNB3Q15768 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNB3Q15768 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNB3Q15768 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNB3Q15768 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNB3Q15768 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNB3Q15768 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNB3Q15768 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNB3Q15768 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNB3Q15768 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNB3Q15768 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNB3Q15768 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNB3Q15768 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNB3Q15768 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNB3Q15768 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNB3Q15768 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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