Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 RBBP6-201ENST00000319715 6229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.752e-7■■■□□ 17
PCBP1Q15365 XPO5-203ENST00000398835 868 ntTSL 59.94□□□□□ -0.822e-7■■■□□ 17
PCBP1Q15365 TAL1-204ENST00000464796 237 ntTSL 1 (best)9.74□□□□□ -0.852e-7■■■□□ 17
PCBP1Q15365 XPO5-205ENST00000450462 633 ntTSL 49.68□□□□□ -0.862e-7■■■□□ 17
PCBP1Q15365 TAL1-205ENST00000465912 433 ntTSL 59.01□□□□□ -0.972e-7■■■□□ 17
PCBP1Q15365 POGZ-221ENST00000594456 561 nt8.56□□□□□ -1.042e-7■■■□□ 17
PCBP1Q15365 RBBP6-207ENST00000564314 3361 ntTSL 28.34□□□□□ -1.072e-7■■■□□ 17
PCBP1Q15365 RBBP6-212ENST00000570185 505 ntTSL 57.68□□□□□ -1.182e-7■■■□□ 17
PCBP1Q15365 ATP5H-203ENST00000538432 533 ntTSL 36.73□□□□□ -1.332e-7■■■□□ 17
PCBP1Q15365 RBBP6-205ENST00000562430 6482 ntTSL 1 (best)5.91□□□□□ -1.462e-7■■■□□ 17
PCBP1Q15365 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.612e-7■■■□□ 17
PCBP1Q15365 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.72e-7■■■□□ 17
PCBP1Q15365 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.187e-8■■■□□ 17
PCBP1Q15365 FAAP20-212ENST00000476803 701 ntTSL 220.3■□□□□ 0.842e-7■■■□□ 17
PCBP1Q15365 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.491e-7■■■□□ 16.9
PCBP1Q15365 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.491e-9■■■□□ 16.9
PCBP1Q15365 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.261e-9■■■□□ 16.9
PCBP1Q15365 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.811e-9■■■□□ 16.9
PCBP1Q15365 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.521e-9■■■□□ 16.9
PCBP1Q15365 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.441e-9■■■□□ 16.9
PCBP1Q15365 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.411e-9■■■□□ 16.9
PCBP1Q15365 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.221e-9■■■□□ 16.9
PCBP1Q15365 MPST-207ENST00000485587 5872 ntTSL 216.52■□□□□ 0.241e-9■■■□□ 16.9
PCBP1Q15365 GSTP1-203ENST00000467591 736 ntTSL 212.69□□□□□ -0.381e-7■■■□□ 16.9
PCBP1Q15365 MBD6-210ENST00000549623 544 ntTSL 423.57■■□□□ 1.365e-14■■■□□ 16.9
PCBP1Q15365 EIF4G1-228ENST00000456033 694 ntTSL 512.76□□□□□ -0.372e-8■■■□□ 16.9
PCBP1Q15365 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.442e-7■■■□□ 16.9
PCBP1Q15365 NBEAL2-211ENST00000486870 1076 ntTSL 219.61■□□□□ 0.731e-6■■■□□ 16.9
PCBP1Q15365 NBEAL2-201ENST00000416683 6364 ntTSL 1 (best)15.66■□□□□ 0.11e-6■■■□□ 16.9
PCBP1Q15365 NBEAL2-204ENST00000443829 3508 ntTSL 1 (best)13.63□□□□□ -0.231e-6■■■□□ 16.9
PCBP1Q15365 NBEAL2-203ENST00000441027 636 ntTSL 312.81□□□□□ -0.361e-6■■■□□ 16.9
PCBP1Q15365 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.712e-6■■■□□ 16.9
PCBP1Q15365 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.685e-10■■■□□ 16.9
PCBP1Q15365 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.093e-7■■■□□ 16.9
PCBP1Q15365 GNAI2-205ENST00000441156 2168 ntTSL 225.56■■□□□ 1.683e-7■■■□□ 16.9
PCBP1Q15365 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.093e-7■■■□□ 16.9
PCBP1Q15365 GNAI2-211ENST00000491100 3886 ntTSL 29.2□□□□□ -0.943e-7■■■□□ 16.9
PCBP1Q15365 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.344e-7■■■□□ 16.9
PCBP1Q15365 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.164e-7■■■□□ 16.9
PCBP1Q15365 SLC39A14-204ENST00000381237 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.44e-7■■■□□ 16.9
PCBP1Q15365 SLC39A14-203ENST00000359741 4641 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.54e-7■■■□□ 16.9
PCBP1Q15365 CHRD-203ENST00000356534 1252 ntTSL 1 (best)22.68■■□□□ 1.222e-6■■■□□ 16.9
PCBP1Q15365 CHRD-208ENST00000460627 4719 ntTSL 218.48■□□□□ 0.552e-6■■■□□ 16.9
PCBP1Q15365 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.092e-6■■■□□ 16.9
PCBP1Q15365 CHRD-205ENST00000448472 3547 ntTSL 1 (best)15.59■□□□□ 0.092e-6■■■□□ 16.9
PCBP1Q15365 CHRD-204ENST00000420973 3492 ntTSL 1 (best)14.51□□□□□ -0.092e-6■■■□□ 16.9
PCBP1Q15365 PKM-224ENST00000569857 1355 ntTSL 513.62□□□□□ -0.232e-10■■■□□ 16.8
PCBP1Q15365 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.042e-6■■■□□ 16.8
PCBP1Q15365 TMEM94-206ENST00000577380 554 ntTSL 427.69■■■□□ 2.023e-8■■■□□ 16.8
PCBP1Q15365 TMEM94-211ENST00000579707 566 ntTSL 524.11■■□□□ 1.453e-8■■■□□ 16.8
PCBP1Q15365 TMEM94-224ENST00000582186 565 ntTSL 424■■□□□ 1.433e-8■■■□□ 16.8
PCBP1Q15365 TMEM94-230ENST00000584383 500 ntTSL 323.75■■□□□ 1.393e-8■■■□□ 16.8
PCBP1Q15365 TMEM94-220ENST00000581519 545 ntTSL 423.16■■□□□ 1.33e-8■■■□□ 16.8
PCBP1Q15365 TAF4-203ENST00000474089 532 ntTSL 221.69■■□□□ 1.063e-8■■■□□ 16.8
PCBP1Q15365 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.83e-8■■■□□ 16.8
PCBP1Q15365 KPNB1-214ENST00000583648 896 ntTSL 416.3■□□□□ 0.28e-14■■■□□ 16.8
PCBP1Q15365 TAF4-202ENST00000436129 2440 ntTSL 215.38■□□□□ 0.053e-8■■■□□ 16.8
PCBP1Q15365 TMEM94-213ENST00000580416 430 ntTSL 414.55□□□□□ -0.083e-8■■■□□ 16.8
PCBP1Q15365 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.123e-8■■■□□ 16.8
PCBP1Q15365 SRC-211ENST00000497734 446 ntTSL 1 (best)14.24□□□□□ -0.133e-8■■■□□ 16.8
PCBP1Q15365 FAM102A-201ENST00000300434 3148 ntTSL 1 (best)13.76□□□□□ -0.213e-8■■■□□ 16.8
PCBP1Q15365 TMEM94-218ENST00000581252 522 ntTSL 512.92□□□□□ -0.343e-8■■■□□ 16.8
PCBP1Q15365 FAM102A-203ENST00000373095 4144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.393e-8■■■□□ 16.8
PCBP1Q15365 FAM102A-202ENST00000373084 3352 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.423e-8■■■□□ 16.8
PCBP1Q15365 FAM102A-204ENST00000465821 4316 ntTSL 211.86□□□□□ -0.513e-8■■■□□ 16.8
PCBP1Q15365 TMEM94-202ENST00000375248 4703 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.63e-8■■■□□ 16.8
PCBP1Q15365 TMEM94-209ENST00000579208 3543 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.63e-8■■■□□ 16.8
PCBP1Q15365 RAB5B-206ENST00000549505 3148 ntTSL 1 (best)10.74□□□□□ -0.693e-8■■■□□ 16.8
PCBP1Q15365 KPNB1-201ENST00000290158 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.83e-8■■■□□ 16.8
PCBP1Q15365 KPNB1-202ENST00000535458 3163 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.973e-8■■■□□ 16.8
PCBP1Q15365 RAB5B-210ENST00000553116 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -13e-8■■■□□ 16.8
PCBP1Q15365 RAB5B-201ENST00000360299 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.233e-8■■■□□ 16.8
PCBP1Q15365 U2SURP-211ENST00000488497 3557 ntTSL 1 (best)7.26□□□□□ -1.253e-8■■■□□ 16.8
PCBP1Q15365 U2SURP-212ENST00000488587 866 ntTSL 36.11□□□□□ -1.433e-8■■■□□ 16.8
PCBP1Q15365 U2SURP-207ENST00000472373 1182 ntTSL 25.93□□□□□ -1.463e-8■■■□□ 16.8
PCBP1Q15365 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.623e-8■■■□□ 16.8
PCBP1Q15365 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.693e-8■■■□□ 16.8
PCBP1Q15365 U2SURP-209ENST00000480029 2855 ntTSL 24.04□□□□□ -1.763e-8■■■□□ 16.8
PCBP1Q15365 U2SURP-203ENST00000463563 4364 ntTSL 23.17□□□□□ -1.93e-8■■■□□ 16.8
PCBP1Q15365 ANXA11-210ENST00000481805 793 ntTSL 223.17■■□□□ 1.34e-9■■■□□ 16.8
PCBP1Q15365 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.737e-9■■■□□ 16.8
PCBP1Q15365 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.181e-7■■■□□ 16.8
PCBP1Q15365 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.441e-6■■■□□ 16.8
PCBP1Q15365 KRT8-210ENST00000548998 918 ntTSL 520.17■□□□□ 0.823e-15■■■□□ 16.8
PCBP1Q15365 KRT8-204ENST00000546826 1165 ntTSL 519.07■□□□□ 0.643e-15■■■□□ 16.8
PCBP1Q15365 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.563e-15■■■□□ 16.8
PCBP1Q15365 KRT8-207ENST00000546921 542 ntTSL 417.82■□□□□ 0.443e-15■■■□□ 16.8
PCBP1Q15365 KRT8-212ENST00000549198 592 ntTSL 215.97■□□□□ 0.153e-15■■■□□ 16.8
PCBP1Q15365 KRT8-214ENST00000551318 507 ntTSL 215.92■□□□□ 0.143e-15■■■□□ 16.8
PCBP1Q15365 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.87e-8■■■□□ 16.8
PCBP1Q15365 DNM1-214ENST00000630850 3442 ntTSL 213.42□□□□□ -0.262e-8■■■□□ 16.8
PCBP1Q15365 APRT-205ENST00000564858 584 ntTSL 223.78■■□□□ 1.41e-7■■■□□ 16.7
PCBP1Q15365 MARCH6-203ENST00000502795 580 ntTSL 415.41■□□□□ 0.066e-29■■■□□ 16.7
PCBP1Q15365 MARCH6-202ENST00000449913 3062 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.786e-29■■■□□ 16.7
PCBP1Q15365 MARCH6-204ENST00000503788 2874 ntTSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.046e-29■■■□□ 16.7
PCBP1Q15365 MARCH6-210ENST00000511802 4734 ntTSL 28.18□□□□□ -1.16e-29■■■□□ 16.7
PCBP1Q15365 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.356e-29■■■□□ 16.7
PCBP1Q15365 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.265e-6■■■□□ 16.7
PCBP1Q15365 UBALD1-204ENST00000588691 281 ntTSL 326.52■■□□□ 1.845e-6■■■□□ 16.7
PCBP1Q15365 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.725e-6■■■□□ 16.7
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