Protein–RNA interactions for Protein: Q15118

PDK1, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK1Q15118 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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