Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB3GAP1Q15042 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms