Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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