Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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