Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
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