Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.49
CDK13Q14004 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CDK13Q14004 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CDK13Q14004 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CDK13Q14004 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CDK13Q14004 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CDK13Q14004 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CDK13Q14004 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
CDK13Q14004 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CDK13Q14004 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CDK13Q14004 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CDK13Q14004 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CDK13Q14004 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CDK13Q14004 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CDK13Q14004 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CDK13Q14004 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CDK13Q14004 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CDK13Q14004 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
CDK13Q14004 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CDK13Q14004 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CDK13Q14004 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CDK13Q14004 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CDK13Q14004 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CDK13Q14004 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CDK13Q14004 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CDK13Q14004 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CDK13Q14004 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CDK13Q14004 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CDK13Q14004 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CDK13Q14004 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CDK13Q14004 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CDK13Q14004 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CDK13Q14004 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CDK13Q14004 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CDK13Q14004 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CDK13Q14004 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CDK13Q14004 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CDK13Q14004 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
CDK13Q14004 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CDK13Q14004 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CDK13Q14004 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CDK13Q14004 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CDK13Q14004 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CDK13Q14004 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CDK13Q14004 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CDK13Q14004 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
CDK13Q14004 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CDK13Q14004 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CDK13Q14004 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CDK13Q14004 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CDK13Q14004 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CDK13Q14004 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CDK13Q14004 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CDK13Q14004 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CDK13Q14004 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CDK13Q14004 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CDK13Q14004 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CDK13Q14004 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
CDK13Q14004 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CDK13Q14004 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CDK13Q14004 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CDK13Q14004 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CDK13Q14004 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CDK13Q14004 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CDK13Q14004 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
CDK13Q14004 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CDK13Q14004 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CDK13Q14004 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
CDK13Q14004 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
CDK13Q14004 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CDK13Q14004 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
CDK13Q14004 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
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