Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CAPSQ13938 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CAPSQ13938 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPSQ13938 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPSQ13938 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPSQ13938 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPSQ13938 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPSQ13938 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPSQ13938 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPSQ13938 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPSQ13938 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPSQ13938 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPSQ13938 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPSQ13938 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPSQ13938 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPSQ13938 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPSQ13938 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPSQ13938 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPSQ13938 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPSQ13938 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPSQ13938 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPSQ13938 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPSQ13938 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPSQ13938 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPSQ13938 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPSQ13938 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPSQ13938 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPSQ13938 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPSQ13938 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPSQ13938 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPSQ13938 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPSQ13938 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPSQ13938 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPSQ13938 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPSQ13938 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPSQ13938 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPSQ13938 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPSQ13938 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPSQ13938 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPSQ13938 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPSQ13938 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPSQ13938 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPSQ13938 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPSQ13938 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPSQ13938 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPSQ13938 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPSQ13938 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPSQ13938 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPSQ13938 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPSQ13938 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPSQ13938 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPSQ13938 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPSQ13938 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPSQ13938 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPSQ13938 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPSQ13938 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPSQ13938 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPSQ13938 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPSQ13938 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPSQ13938 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPSQ13938 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPSQ13938 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPSQ13938 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPSQ13938 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPSQ13938 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPSQ13938 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPSQ13938 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPSQ13938 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPSQ13938 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPSQ13938 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPSQ13938 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPSQ13938 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPSQ13938 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPSQ13938 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPSQ13938 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPSQ13938 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPSQ13938 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPSQ13938 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPSQ13938 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPSQ13938 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPSQ13938 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPSQ13938 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPSQ13938 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPSQ13938 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPSQ13938 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPSQ13938 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPSQ13938 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPSQ13938 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPSQ13938 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPSQ13938 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPSQ13938 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPSQ13938 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms