Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FHL3Q13643 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FHL3Q13643 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FHL3Q13643 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FHL3Q13643 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FHL3Q13643 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FHL3Q13643 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FHL3Q13643 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FHL3Q13643 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
FHL3Q13643 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FHL3Q13643 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FHL3Q13643 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FHL3Q13643 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FHL3Q13643 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FHL3Q13643 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FHL3Q13643 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FHL3Q13643 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
FHL3Q13643 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FHL3Q13643 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FHL3Q13643 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FHL3Q13643 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FHL3Q13643 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FHL3Q13643 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
FHL3Q13643 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
FHL3Q13643 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FHL3Q13643 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FHL3Q13643 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FHL3Q13643 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FHL3Q13643 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FHL3Q13643 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FHL3Q13643 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FHL3Q13643 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FHL3Q13643 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FHL3Q13643 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FHL3Q13643 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FHL3Q13643 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FHL3Q13643 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FHL3Q13643 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
FHL3Q13643 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FHL3Q13643 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FHL3Q13643 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FHL3Q13643 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FHL3Q13643 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
FHL3Q13643 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FHL3Q13643 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FHL3Q13643 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FHL3Q13643 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FHL3Q13643 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
FHL3Q13643 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FHL3Q13643 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FHL3Q13643 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FHL3Q13643 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FHL3Q13643 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FHL3Q13643 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FHL3Q13643 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FHL3Q13643 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FHL3Q13643 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FHL3Q13643 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FHL3Q13643 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
FHL3Q13643 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FHL3Q13643 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FHL3Q13643 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FHL3Q13643 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FHL3Q13643 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FHL3Q13643 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FHL3Q13643 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FHL3Q13643 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FHL3Q13643 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FHL3Q13643 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FHL3Q13643 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FHL3Q13643 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FHL3Q13643 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
FHL3Q13643 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FHL3Q13643 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FHL3Q13643 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FHL3Q13643 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FHL3Q13643 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FHL3Q13643 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
FHL3Q13643 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
FHL3Q13643 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
FHL3Q13643 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FHL3Q13643 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FHL3Q13643 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FHL3Q13643 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FHL3Q13643 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FHL3Q13643 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FHL3Q13643 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FHL3Q13643 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FHL3Q13643 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FHL3Q13643 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FHL3Q13643 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FHL3Q13643 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FHL3Q13643 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FHL3Q13643 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FHL3Q13643 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FHL3Q13643 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FHL3Q13643 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FHL3Q13643 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FHL3Q13643 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.03■□□□□ -0
FHL3Q13643 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms