Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CUL4BQ13620 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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