Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PEX6Q13608 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PEX6Q13608 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PEX6Q13608 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PEX6Q13608 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PEX6Q13608 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PEX6Q13608 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PEX6Q13608 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PEX6Q13608 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PEX6Q13608 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PEX6Q13608 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PEX6Q13608 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PEX6Q13608 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PEX6Q13608 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PEX6Q13608 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PEX6Q13608 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PEX6Q13608 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PEX6Q13608 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PEX6Q13608 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PEX6Q13608 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PEX6Q13608 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PEX6Q13608 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PEX6Q13608 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PEX6Q13608 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PEX6Q13608 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PEX6Q13608 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PEX6Q13608 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PEX6Q13608 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
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PEX6Q13608 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PEX6Q13608 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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PEX6Q13608 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PEX6Q13608 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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PEX6Q13608 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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PEX6Q13608 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PEX6Q13608 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PEX6Q13608 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PEX6Q13608 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PEX6Q13608 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PEX6Q13608 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PEX6Q13608 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PEX6Q13608 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PEX6Q13608 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PEX6Q13608 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PEX6Q13608 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PEX6Q13608 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PEX6Q13608 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PEX6Q13608 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PEX6Q13608 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PEX6Q13608 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PEX6Q13608 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
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