Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms