Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms