Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms