Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NR1H3Q13133 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NR1H3Q13133 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NR1H3Q13133 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NR1H3Q13133 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NR1H3Q13133 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NR1H3Q13133 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NR1H3Q13133 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NR1H3Q13133 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NR1H3Q13133 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NR1H3Q13133 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NR1H3Q13133 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NR1H3Q13133 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NR1H3Q13133 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NR1H3Q13133 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NR1H3Q13133 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NR1H3Q13133 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NR1H3Q13133 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NR1H3Q13133 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NR1H3Q13133 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NR1H3Q13133 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NR1H3Q13133 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NR1H3Q13133 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NR1H3Q13133 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NR1H3Q13133 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NR1H3Q13133 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NR1H3Q13133 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NR1H3Q13133 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NR1H3Q13133 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NR1H3Q13133 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NR1H3Q13133 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NR1H3Q13133 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NR1H3Q13133 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NR1H3Q13133 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NR1H3Q13133 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NR1H3Q13133 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NR1H3Q13133 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NR1H3Q13133 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NR1H3Q13133 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NR1H3Q13133 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NR1H3Q13133 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NR1H3Q13133 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NR1H3Q13133 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NR1H3Q13133 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NR1H3Q13133 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NR1H3Q13133 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NR1H3Q13133 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NR1H3Q13133 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NR1H3Q13133 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NR1H3Q13133 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NR1H3Q13133 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NR1H3Q13133 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NR1H3Q13133 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NR1H3Q13133 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NR1H3Q13133 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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NR1H3Q13133 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NR1H3Q13133 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NR1H3Q13133 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NR1H3Q13133 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NR1H3Q13133 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
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NR1H3Q13133 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
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NR1H3Q13133 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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NR1H3Q13133 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
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NR1H3Q13133 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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